خلاصه‌اي از توصيف اختراع؛ بر طبق گزارش رسمي سازمان جهاني آلرژي (WAO) در حال حاضر قريب 30 درصد جمعيت جهان؛ انواع گوناگون بيماري آلرژي را تحمل مي¬كنند. يكي از مهمترين موارد ايمني زيستي پروتئين¬هاي نوتركيب، اطمينان از عدم آلرژنيسيته است. آناليزهاي بيوانفورماتيكي نقش مهمي در ارزيابي آلرژنيسيته پروتئين¬ها دارد. آناليز بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئين¬هاي توسط پايگاه¬هاي داده توالي آلرژن¬ها انجام مي¬شود. پايگاه‌هاي داده آلرژن مختلف از ابزارها و الگوريتم‌هاي متفاوتي براي جستجوي تشابه استفاده مي‌كنند. الگوريتم متداول به سه روش بررسي همترازي توالي كامل، بررسي ميزان همانندي در پنجره¬هاي 80 اسيدآمينه¬اي و جستجو براي توالي‌هاي به‌هم‌پيوسته مشابه در پنجره¬هاي 6 تا 8 اسيدآمينه¬اي است. جستجو براي توالي‌هاي به‌هم‌پيوسته مشابه در پنجره¬هاي 6 تا 8 اسيدآمينه¬اي با خطاهاي مثبت زيادي همراه است. ارزيابي بيوانفورماتيكي آلرژنيسيته پروتئين¬ها نيازمند بررسي¬هاي دقيق¬تر ساختاري است تا اتقان نتايج بيشتر شود. اختراع ما براساس فرآيندهايي به شرح زير است: 1- مطالعه همانندي توالي مورد نظر در سطح همترازي توالي كامل 2- بررسي ميزان همانندي در پنجره¬هاي 80 اسيدآمينه¬اي 3- مطالعه همانندي توالي با اپي¬توپ¬هاي شناسايي‌شده 4- مطالعه هضم پروتئيني و پايداري اپي توپ 5- مطالعات ساختاري جهت تعيين در سطح يا داخل بودن اپي توپ 6- مطالعات ساختاري جهت تعيين اپي توپ‌هاي تركيبي

خلاصه: قسمت اول فرايند فوق شامل يك بخش جهت ورود پروتئوم مورد نظر محقق براي جستجو در آن مي باشدكه شامل بخشي جهت دريافت موتيف يا دومين مورد نظر و جستجو گر براي يافتن پروتئين مورد نظر داراي موتيف يا دومين مورد نظر مي باشد، كه پس از جستجو پروتئين هاي مربوطه در جدولي ارائه خواهند شد . در قسمت دوم فرايند يك بخش ورود نام لاكتوباسيلوس مورد نظر جهت فراخواني نوع خاصي از پروتئين ها بنام پروتئين هاي وابسته به سورتاز SDPs موجود درآن باكتري از بانك داده ي فرايند موجود مي باشد . كه پس از جستجوي بانك داده، SDP هاي موجود در لاكتوباسيلوس مد نظر همراه با اطلاعاتي شامل كد شناسايي پروتئين و نام پروتئين و تعداد كل اسيد هاي آمينه موجود در آن ارائه داده خواهند شد .